اين دانشگاه در راه دستيابي به اهداف برنامه هاي راهبردي توسعه كشور بر اساس نقشه راه ترسيم شده در "سند نقشه جامع علمي كشور" مصوب شوراي عالي انقلاب فرهنگي، از سال 1376 اقدام به گسترش و تقويت دوره هاي تحصيلات تكميلي خود نمود به گونه اي كه اكنون با گذشت قريب به 25 سال فعاليت مستمر در اين زمينه،  موفق به اخذ مجوز پذيرش دانشجو درحدود 100 رشته-گرايش در دوره هاي كارشناسي ارشد و حدود 44 رشته-گرايش در دوره هاي دكتري تخصصي شده است. همچنين اين دانشگاه در راستاي تربيت و تأمين كارشناسان آگاه ، ماهر و كار آمد براي اداره امور ارگان ها و سازمان‌هاي كشور با مجوز شوراي گسترش آموزش عالي اقدام به تاسيس و راه اندازي مركز آموزش‌هاي الكترونيكي خود در سال 1391 نموده است و هم اكنون در 5 رشته گرايش در مقطع كارشناسي ارشد دانشجو مي پذيرد. همچنين پرديس خودگردان دانشگاه شاهرود در سال 1392 با مجوز شوراي گسترش آموزش عالي راه اندازي گرديد و هم اكنون در 34 رشته – گرايش مقطع دكتري و 93 رشته- گرايش در مقطع كارشناسي ارشد دانشجو مي پذيرد. با توجه به توسعه دوره‌هاي تحصيلات تكميلي و نياز روزافزون به اعمال مديريت مستقل و متمركز بر امور اين دوره‌ها، مديريت تحصيلات تكميلي دانشگاه در حوزه معاونت آموزشي و تحصيلات تكميلي تأسيس گرديد. مهمترين خدماتي كه از سوي حوزه مديريت تحصيلات تكميلي دانشگاه ارائه مي‌گردد به شرح ذيل است:

1- پذيرش و ثبت نام اوليه، تشكيل پرونده، صدور كارت دانشجويي و معرفي پذيرفته‌شدگان به دانشكده‌هاي مربوطه جهت شروع به تحصيل

2- صدور معرفي‌نامه‌ها و احكام مربوط به وضعيت تحصيلي دانشجويان از قبيل : گواهي رتبه، مشروطي، اخراجي، انصرافي، مرخصي تحصيلي، مهمان‌شدن، اضافه سنوات، نظام وظيفه (صدور معافيت تحصيلي در بدو ورود و اعلام فراغت از تحصيل يا اخراجي يا انصرافي دانشجويان به نظام وظيفه)، صدور برگ تسويه‌حساب دانشجو با بخش‌هاي مختلف دانشگاه به هنگام فراغت از تحصيل، اخراج يا انصراف

3-كنترل ثبت نام ترم به ترم، كنترل نمرات، صدور مجوز دفاع پس از بررسي همه‌جانبه پرونده دانشجويان، درخواست تاييديه تحصيلي دانشجويان جديد الورود از دانشگاه قبلي آنان

4- مشاوره و راهنمايي دانشجويان و مراجعان جهت رفع مشكلات آموزشي

5- بايگاني و نگهداري سوابق تحصيلي دانشجويان

6-  اعلام فراغت از تحصيل دانشجويان پس از تكميل پرونده آنان

7-برگزاري و اداره جلسات كميته تحصيلات تكميلي دانشگاه جهت بررسي موارد آموزشي دانشجويان.